强直性脊柱炎的发生除了与遗传基因和病原微生物感染关联外，还涉及机体的免疫因素。从病原学角度来说，慢性感染性疾病大多涉及病原体或其成分与机体免疫应答的相互作用，而其在发病机制中的作用，大多是激发机体对它的炎性应答和免疫应答。强直性脊柱炎的发病同样涉及机体的诸多免疫应答反应。
强直性脊柱炎的基本病理是伴有慢性炎症的肌腱附着点炎。在此炎症过程中，许多免疫细胞或免疫因子对微生物或自身抗原的应答起作用，引起肌腱附着点炎部位的纤维化、骨化。
强直性脊柱炎存在多种抗体和细胞免疫改变，具有自身免疫性疾病的特征。强直性脊柱炎患者多有迟发型超敏反应低下，血清中虽然缺乏抗自身变性IgG抗体（类风湿因子阴性），但活动期血清IgG、IgM，尤其是IgA水平经常增高，强直性脊柱炎患者血清中抗体的升高提示该病涉及体液免疫，可能与克雷伯菌感染有关。强直性脊柱炎患者体内存在免疫细胞比例失衡，且随着炎症的活动，这一失衡更为明显。
总之，强直性脊柱炎的发病与免疫因素机体免疫应答存在密切关系，这种免疫应答包括体液免疫和细胞免疫应答（或机体的获得性和天然性免疫应答）两个方面。
